季节更替，第二个春天即将到来。 　　一个是劣等生的哥哥，一个是优等生的妹妹。两人在魔法科高校的生活即将结束第一学年。 　　达也和深雪利用春假，来到小笠原诸岛的一处别墅度假。 　　在短暂的休息中，达也一行人尽情放松。 　　然而，一个名叫九亜的少女突然出现在他们面前。这位从海军基地逃出来的少女向达也提出了一个请求……